John Wilkinson a été élu pour la première fois à l'Assemblée législative de l'Ontario en 2003 à titre de député provincial de Perth-Middlesex et réélu en octobre 2007. En juin 2009, il a été nommé ministre du Revenu. Auparavant, il a occupé les fonctions de ministre de la Recherche et de l'Innovation. John a également été adjoint parlementaire du premier ministre Dalton McGuinty, de même qu'adjoint parlementaire à la ministre de l'Environnement. Le ministre des Finances l’a également nommé vice-président de la Société d'évaluation foncière des municipalités.
John Wilkinson est le premier planificateur financier agréé à être élu à l'Assemblée législative de l'Ontario. Avant d'entrer en politique, John a fondé Wilkinson & Keller Financial Planning Ltd. of Stratford, petite entreprise prospère.
Connu pour ses longs états de service, John s’est impliqué tant pour son église que pour sa collectivité. Il a été à la fois le plus jeune président et membre honoraire du club Kiwanis de Stratford. Il a présidé avec succès plusieurs campagnes de collecte de fonds à l’échelle locale.
En 2002, la Fondation canadienne de la fibrose kystique lui a remis à sa plus haute distinction honorant un bénévole, le prix Julia. En 2003, il a reçu la Médaille du jubilé d'or de la reine pour les dix années de travail exceptionnel qu'il a consacrées pour aider à guérir la fibrose kystique, la principale cause de décès pour cause génétique chez les enfants canadiens. En 2006, John a été nommé membre Paul Harris de Rotary International pour son activité humanitaire.
Il est diplômé de la faculté de musique de l'Université Western Ontario. Lui et son épouse ont trois enfants, une fille qui est à l’université et deux fils qui sont à l’école secondaire.